Mit ihrer Schwerpunktbildung in der Forschung erfüllt die JGU eine der wesentlichen Voraussetzungen für ihre internationale Konkurrenzfähigkeit und ist damit sehr erfolgreich. Federführend bei der Schwerpunktbildung ist das Gutenberg Forschungskolleg, dessen Leitungsgremium aus exzellenten Forschenden der JGU und ihrer außeruniversitären Partnerinstitute besteht.

In der Teilchenphysik ist die JGU weltweit führend. Bestätigt wurde ihre internationale Spitzenstellung in diesem Forschungsfeld unter anderem durch die Auszeichnung des Forschungsverbunds PRISMA++ (Precision Physics, Fundamental Interactions and Structure of Matter) als Exzellenzcluster im Jahr 2025.

Mit der Forschungsinitiative unterstützt das rheinland-pfälzische Wissenschaftsministerium die JGU gezielt im nationalen und internationalen Wettbewerb um Fördermittel, Spitzenforschende sowie den wissenschaftlichen Nachwuchs. Zurzeit fördert es 12 Verbundprojekte der Universität mit insgesamt bis zu 9,4 Millionen Euro pro Jahr. Diese Projekte repräsentieren neben anderen Einrichtungen, wie dem Exzellenzcluster PRISMA+, die Spitzenforschung der Universität.

Die Zusammenarbeit mit anderen Forschungseinrichtungen und der Wirtschaft ist eine der Grundlagen für die stetige Verbesserung der JGU. Mit Partnern in Mainz und der Umgebung, darunter die forschenden Unternehmen BioNTech und Boehringer Ingelheim, kooperiert sie in der Mainzer Wissenschaftsallianz. Mit der Goethe-Universität Frankfurt am Main und der Technischen Universität Darmstadt bildet sie die strategische Allianz der Rhein-Main-Universitäten (RMU) und mit acht Partneruniversitäten im europäischen Ausland das von der EU geförderte Hochschulnetzwerk der FORTHEM-Alliance.

Als internationaler Ort des Forschens ist die JGU der Grenzüberschreitung zwischen den Nationen und Kulturen in besonderer Weise verpflichtet. Das ist in ihrem Leitbild und ihrem Strategiekonzept festgeschrieben und spiegelt sich in ihren starken Auslandsbeziehungen wider. Die internationale Arbeit ihrer Wissenschaftler*innen wird durch ein Netzwerk von rund 150 Kooperationen mit Partnerhochschulen auf allen Kontinenten unterstützt.

Die JGU unterstützt ihren wissenschaftlichen und künstlerischen Nachwuchs durch vielfältige Förder- und Weiterbildungsangebote sowie Beratung für Karriereziele innerhalb und außerhalb der Wissenschaft. Eine umfassende Übersicht über die entsprechenden Leistungen bietet das Webportal des Gutenberg Kolleg für wissenschaftliche Karrierewege (GKK), die zentrale Einrichtung für den wissenschaftlichen und künstlerischen Nachwuchs der JGU.

Die JGU versteht sich als integraler Bestandteil der Gesellschaft, mit der sie eng und vertrauensvoll zusammenarbeitet, und sieht im Wissensaustausch mit ihr eine zentrale Aufgabe. Als offene Universität hat sie ein vielfältiges Spektrum an Transferaktivitäten entwickelt, das vom klassischen Technologietransfer über ein breites Angebot zur beruflichen Weiterbildung bis zu zahlreichen PUSH-Formaten (Public Understanding of Science and Humanities) reicht. In der wissenschaftlichen Praxis unterstützt sie zahlreiche Aktivitäten im Bereich Open Science.

Aktive Unterstützung bei Kooperationsvorhaben der JGU mit Unternehmen und anderen Partnern außerhalb der Wissenschaft sowie bei der Verwertung schutzrechtsfähiger wissenschaftlicher Ergebnisse leistet die Abteilung Forschung und Technologietransfer. Unterstützung für angehende Gründer*innen bietet das Startup Center der JGU, das Mitglied des hochschulübergreifenden Gründungsbüros Mainz ist.

Für das außeruniversitäre Publikum besonders in und um Mainz bietet die JGU ein facettenreiches Portfolio der Wissensvermittlung: Neben eigenen Formaten wie der Johannes Gutenberg-Stiftungsprofessur, den Veranstaltungen des Studium generale oder der Reihe „Physik im Theater“ sowie digitalen Angeboten wie dem JGU-Magazin und dem Forschungspodcast „Minds of Mainz“ beteiligt sich die Universität am jährlichen Wissenschaftsmarkt und anderen populärwissenschaftlichen Formaten der Mainzer Wissenschaftsallianz sowie der städtischen Kampagne „Wissen im Herzen“.

Die Abteilung Forschung und Technologietransfer der JGU bietet deren Wissenschaftler*innen umfassende Beratung. Sie unterstützt bei der Suche nach Fördermöglichkeiten, vermittelt Anschubfinanzierungen, begleitet Antragsstellungen und berät zum Forschungsdatenmanagement. Sie hilft beim Erstellen von Kooperationsverträgen, informiert über Patentierungs- und Lizenzierungsverfahren, kümmert sich um die schutzrechtliche Abwicklung von Diensterfindungen und ist Ansprechpartnerin bei Ideen zur Unternehmensgründung.

Open Science fördert die Zugänglichkeit, Nachvollziehbarkeit und Nachnutzung wissenschaftlicher Arbeit und ermöglicht eine gesellschaftliche Teilhabe an Forschung.

Die JGU fühlt sich dem Open-Access-Gedanken verpflichtet und unterstützt nationale und internationale Initiativen für einen freien Zugang zu wissenschaftlichen Erkenntnissen. Ihr Bekenntnis zu einer offenen Wissenschaft zeigt sich in zahlreichen ihrer Maßnahmen wie ihrem Open-Access-Repositorium (Gutenberg Open Science), der Finanzierung von Open-Access-Publikationen sowie zahlreichen weiteren Angeboten und Outreach-Formaten zu Aspekten einer offenen Wissenschaftspraxis. Die JGU ist zudem Mitglied im Verein Nationale Forschungsdateninfrastruktur.